扩大高校和科研院所自主权
《建议》提出：扩大高校和科研院所自主权，赋予创新领军人才更大人财物支配权、技术路线决策权。实行以增加知识价值为导向的分配政策，提高科研人员成果转化收益分享比例，鼓励人才弘扬奉献精神。
关于高校办学自主权，教育部在今年也有相应的举措。截至2015年7月，教育部核准发布了全部112所“211工程”高校(含38所“985工程”高校，军事院校除外)章程。
各高校的章程提出，坚持和完善党委领导下的校长负责制，明确办学自主权的运行与监督机制，高校自主办学从此有章程可依。
同时，高校章程还在明确学校办学方向，健全学术治理体系、推进教授治学，完善校内管理体制和治理框架，保障师生合法权益，完善民主监督和社会参与机制等方面，都结合实际做出了具体规定。
使若干高校和一批学科达到或接近世界一流水平
《建议》提出：提高高校教学水平和创新能力，使若干高校和一批学科达到或接近世界一流水平。
2015年8月18日，中央全面深化改革领导小组第十五次会议通过了《统筹推进世界一流大学和一流学科建设总体方案》。
会议强调，要推动一批高水平大学和学科进入世界一流行列或前列，提升高等教育综合实力和国际竞争力，培养一流人才，产出一流成果。要引导和支持高等院校优化学科结构，凝练学科发展方向，突出学科建设重点，通过体制机制改革激发高校内生动力和活力。
建设现代职业教育体系 鼓励普通本科高校向应用型转变
《建议》提出：建设现代职业教育体系，推进产教融合、校企合作。优化学科专业布局和人才培养机制，鼓励具备条件的普通本科高校向应用型转变。
在职业教育建设方面，教育部近日印发了《高等职业教育创新发展行动计划(2015-2018年)》。《行动计划》明确，到2018年，专科层次职业教育在校生要达到1420万人，接受本科层次职业教育学生达到一定规模。
《行动计划》明确，通过三年建设，高等职业教育整体实力显著增强，人才培养的结构更加合理、质量持续提高，服务中国制造2025的能力和服务经济社会发展的水平显著提升，促使高等教育结构优化成效更加明显，推动现代职业教育体系日臻完善。
此外，十三五规划建议还提出，要提高教育质量。全面贯彻党的教育方针，落实立德树人根本任务，加强社会主义核心价值观教育，培养德智体美全面发展的社会主义建设者和接班人。深化教育改革，把增强学生社会责任感、创新精神、实践能力作为重点任务贯彻到国民教育全过程。
推动义务教育均衡发展，全面提高教育教学质量。普及高中阶段教育，逐步分类推进中等职业教育免除学杂费，率先从建档立卡的家庭经济困难学生实施普通高中免除学杂费。发展学前教育，鼓励普惠性幼儿园发展。完善资助方式，实现家庭经济困难学生资助全覆盖。
促进教育公平。加快城乡义务教育公办学校标准化建设，加强教师队伍特别是乡村教师队伍建设，推进城乡教师交流。办好特殊教育。
落实并深化考试招生制度改革和教育教学改革。建立个人学习账号和学分累计制度，畅通继续教育、终身学习通道。推进教育信息化，发展远程教育，扩大优质教育 资源覆盖面。完善教育督导，加强社会监督。支持和规范民办教育发展，鼓励社会力量和民间资本提供多样化教育服务。
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