1月9日上午，2016年度国家科学技术奖在北京颁出，屠呦呦研究员和赵忠贤院士获得国家最高科学技术奖。数据显示，2016年国家科学技术奖共授予287项（人），授奖总数比2015年减少15项。
国家科学技术奖是衡量科技创新和重大成果产出的重要指标之一。上海2016年科技创新硕果累累，获奖总数比2015年增加了10项，达到了52项。在高等级奖项中，2项国家科学技术进步特等奖，3项国家技术发明一等奖，17项国家科学技术进步一等奖当中，均有上海科创力量的身影。
瞄准世界科技前沿领域和顶尖水平，在基础科技领域获创新成果。如中科院上海应用物理研究所马余刚获得的自然科学奖二等奖项目。他领衔国内相关实验队伍，在极端相对论能区的重离子碰撞中探测到两个反物质原子核，并研究高温高密夸克物质的强子谱学特征与集体运动性质，论文分别发表在Science和Nature上。对认识自然界的物质形态，对推动核物理发展，对理解宇宙早期物质形态的演化具有十分重要的意义。
中科院院士、中科院上海有机所林国强主持的“高效不对称碳-碳键构筑若干新方法的研究”也获自然科学奖二等奖。研究人员围绕碳–碳键的高效不对称构筑这一挑战性问题，针对手性胺、双烯和硫烯的不对称合成及催化反应开展系统研究，取得了国际领先成果，相关研究论文他引单篇最高165次。并申请中国发明专利10项，授权6项，实施转让1项，对手性有机化学及药物研发等领域具有重要意义，极大地推动了不对称反应的研究与发展。
同济大学李杰教授建立了工程随机系统的概率密度演化理论，为重大工程结构的动力灾变分析和抗灾可靠性设计提供了关键理论基础。2014年李杰教授获得本领域权威学术成就奖——美国土木工程师协会颁发的“弗洛伊登瑟尔奖章”（Freudenthal Medal）。
上海注重服务国家发展全局，并以此作为科技创新中心建设的立足点和出发点。同济大学童小华领衔完成的“航天重大工程的遥感空间信息可信度理论与关键技术”项目，荣获国家科学技术进步一等奖。面向国家航天重大工程，针对测绘遥感空间数据的可信度保障问题，构建了理论方法，突破了航天探测场景静态要素可信度量、航天器动态数据可信控制和海量遥感空间数据产品可信评估等共性关键技术。成果成功用于嫦娥探月、测绘卫星、载人航天和国土资源调查等重大工程，为我国航天发展的测绘保障做出了贡献。
上海大学谢少荣领衔完成的“复杂岛礁水域无人自主测量关键技术及装备”，荣获国家技术发明奖二等奖。以南海岛礁海域为代表的岛礁海域测量事关国家经济建设、领土完整和国防安全。该项目自主研制吃水浅、能自主航行、自主避障、自主作业的无人测量艇，装备中国海事局海巡船、国家海洋局海监船，推动我国海洋无人自主测量艇行业的科技进步。
中学院上海药物研究所果德安领衔的“国际化导向的中药整体质量标准体系创建与应用”，荣获国家科学技术进步二等奖。基于“中药标准主导国际标准制订”战略目标，建立了系列被中国药典和国际主流药典采纳的中药质量标准及相关指导原则。开辟了我国学者制定《美国药典》和《欧洲药典》中药标准的先河，为中药标准国际化做出了开拓性贡献。
围绕产业链部署创新链，科技创新立足产业发展，形成一批重要的产业升级的关键核心技术。上海航天设备制造总厂孟光领衔的“航天大型复杂结构件特种成套制造装备及工艺”，荣获国家科学技术进步二等奖。运载火箭的制造能力是航天强国的重要标志。项目团队自主研发了火箭贮箱5大关键成套制造装备及工艺，显著提升了箭体的制造水平，实现了箭体的绿色、高效、节能、高质量和高可靠制造。
同济大学蒋昌俊领衔的“网络交易支付系统风险防控关键技术及其应用”项目，荣获国家科学技术进步二等奖。网络交易支付欺诈呈现爆炸性增长趋势，传统防御技术难以应对。该项目以行为证书与认证机制为创新核心，构建了网络交易支付系统风险防控技术体系和平台，交易资损率由十万分之3.4降低到十万分之0.97，技术水平居于该领域国际领先，显著提升了中国在互联网产业的国际地位。
法国籍科学家简-埃蒙德 阿布瑞尔(Jean-Raymond Abrial)教授是国际著名工业控制领域可信软件开发方法的奠基人，安全攸关软件开发方法 B 方法的创建者。自 2005 年以来，与何积丰院士领导的可信计算研究团队进行合作，优势互补，强强联合，首次把 B 方法系统级的软件安全保障方案引入中国，在轨道交通、汽车电子、航空航天领域提供解决方案，保障了其核心系统的高可靠与高安全，为国内安全攸关领域自主可控产品的研发做出了极其重要的贡献。
东华大学张清华领衔的“干法仿聚酰胺纤维植被关键技术及产业化”项目，荣获国家科学技术进步二等奖。聚酰亚胺是典型的高性能纤维。该项目提出了“反应纺丝”制备聚酰亚胺纤维的新原理，开创并建成国际上首条干法纺年产1000吨级聚酰亚胺生产线。极大地提高了生产效率，产品性能远超国外产品。促进了化纤产业结构的调整，对于我国高性能纤维的跨越式发展具有重大意义。
保障和改善民生，是政府工作的出发点和落脚点。在2016年的获奖项目中，公众普遍关注的医疗卫生、环境保护、能源资源等方面涌现了大量优秀成果。
大型火灾、工业爆炸等造成的严重烧创伤具有高致残、高危害的特点，治疗手段匮乏，疗效极差，是世界性医学难题之一。上海交通大学医学院附属第九人民医院李青峰项目组首次提出“组织预构修复”的治疗策略，创建的“全脸面预构重建技术”规避了异体脸面移植存在的免疫抑制、供体缺乏、伦理等问题，被国际同行誉为“中国式换脸”。推动了我国烧创伤修复重建外科的发展。
青光眼是全球第一位不可逆致盲眼病。复旦大学附属眼耳鼻喉科医院孙兴怀团队从临床实际出发，结合专业进展和新技术，就公众普遍关心和青光眼患者普遍存在的问题，用通俗的语言、形象的比拟，撰写《了解青光眼 战胜青光眼》科普书，并通过青光眼俱乐部、网络新媒体、社区咨询和义诊等多样化的科普宣教，建立起青光眼科普防治和自我保健的“上海模式”，得到了国际学术界的重视和推荐。
华东理工大学王辅臣领衔的“大型高效水煤浆气化过程关键技术创新及应用”项目，荣获国家科学技术进步二等奖。煤炭清洁高效利用是协调绿色发展的重大战略。该项目突破水煤浆气化大型化、高效率、长周期稳定运行等技术瓶颈，形成国际领先的大型高效水煤浆气化成套技术和装备，应用企业32家，与国外技术相比仅专利费就节省3.8亿元，有力提升了我国煤化工领域的技术装备水平和行业竞争力。
据悉，2016年度上海市荣获国家科学技术奖的重大科技成果中，上海参与全国跨地域协作项目达到28项，占比超过一半，有高校科研团队与外省市合作开展研究，也有企业利用技术优势为全国提供产业平台支撑，显示上海在知识溢出、产业带动方面能够发挥越来越重要的作用。
青年科学家不断成长为科研和学术带头人，成为上海建设具有全球影响力的科创中心的中坚力量。2016年上海市获奖项目中，自然科学二等奖获得者樊春海（1974年出生）、技术发明二等奖获得者谢少荣（1972年出生）、科技进步一等奖获得者童小华（1971年出生）、科技进步二等奖获得者何斌（1975年出生）、科技进步二等奖获得者张清华（1970年出生），均为70后。
