华南农业大学植物保护学院研究员金丰良和副研究员庞锐团队,通过广泛收集和分析昆虫基因数据,构建了昆虫学领域中最为广泛、全面且标准化的综合昆虫解毒代谢核心基因细胞色素P450信息平台。该平台为昆虫抗药性的形成与适应性进化研究提供了重要资源。近日,相关成果在线发表于《分子生态资源》(Molecular Ecology Resources)。
昆虫是地球上数量最多、种类最丰富的动物群体,直接影响农业生产和粮食安全。细胞色素P450在昆虫体内负责代谢植物化感物质、杀虫剂和环境污染物,并在昆虫抗药性的形成及其与植物之间的相互作用中发挥着至关重要的作用。此外,该基因家族在植物保护和害虫防治中也具有重要意义。随着测序技术的发展和成本的降低,越来越多的昆虫已完成全基因组测序,发现了大量的P450基因。然而,这些P450基因的数据缺乏统一的格式标准以及深入的信息挖掘。
该研究在国家重点研发计划经费和数据空间技术与系统全国重点实验室开放基金的资助下,从682种昆虫的高质量基因组中识别出P450基因家族。研究团队通过对这些重新识别的P450基因进行注释、系统发育分析和结构解析,构建了昆虫细胞色素P450数据库(ICPD),提供有关昆虫P450多样性和结构特征的综合数据。此外,ICPD支持蛋白质结构的交互式可视化,以及分子对接、突变蛋白结构预测和蛋白质结构相似性计算等服务。
该数据库旨在为学术界及相关领域的用户提供两方面的支持:一是提供关于昆虫P450基因家族的免费且用户友好的资源;二是允许用户比较多个P450蛋白结构,并能够使用任意化学分子构建配体对接。这些资源和工具将大大促进对昆虫P450基因多样性和进化的研究。同时,它们也有助于P450酶的挖掘与功能分析,对未来新杀虫剂的设计具有重要价值。
相关论文信息:https://doi.org/10.1111/1755-0998.14070
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