据美国物理学家组织网近日报道，由哈佛大学公共卫生学院和布洛德研究所共同组成的一个研究小组，利用全基因组测序已经追查到去年在欧洲大范围致病的大肠杆菌（E.coli）暴发路径。相关研究结果提前刊登在近日美国《国家科学院院刊》在线版上。
这是第一个采用基因组测序的方法来研究食源性暴发的动态，由此为了解未来疫情和传染病的出现和蔓延提供了新途径。这项研究的合作者还包括法国巴斯德研究所、丹麦国立血清研究所等。
在生物学中，一个生物体的基因组是指包含在该生物的DNA（部分病毒是RNA）中的全部遗传信息。确定哪些DNA变异导致特定性状或疾病则需要进行个体间比较。该研究的主要作者、传染性疾病动态中心研究者永纳坦·格拉德说，寻找疫情暴发的多种细菌的基因组之间的差异，即可得到疫情发生的线索。像做侦探工作一样，研究人员通过这种方式跟踪疫情，可了解未来疾病暴发路径。
去年夏天在德国，因大肠杆菌病毒的肆虐成千上万人生病，50多人死亡，之后在法国也引起了小范围的暴发。研究人员将这两国的致病大肠杆菌株对比分析，发现菌株相同。然而，利用全基因组测序分析菌株之间的差异时，研究人员发现：所有与德国当地相关暴发的菌株都几乎是相同的，而出现在法国菌株表现出更大的多样性，显示出是从德国菌株分离出来的一个子集。
随着基因组测序成本的下降，未来将其与传统的流行病学方法相结合，可以为人们对传染病的出现及蔓延提供更深入的了解，将有助于指导公共卫生预防措施。（来源：科技日报 华凌）
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