近日,复旦大学公共卫生学院青年教师熊成龙、张志杰等以先进的生物信息学为手段,对本次H7N9禽流感病毒基因进行研究和分析,找到了该病毒的起源和演化规律,发现该病毒的两个最重要蛋白HA和NA并非如此前中外学术界专家所认为的“分别来源于中国和韩国禽类”,而是起源于中国华东地区的家禽或野鸟。
该成果对预防和溯源流感与禽流感有重要意义,相关论文已在线发表在美国《临床感染病》杂志上。
今年2月起,我国华东地区陆续出现系列流感样病例,对于该病毒的起源,中外学术界普遍认为来自中韩禽类。他们的根据是:采集到的1株H7亚型HA(即H7N3病毒)来源于中国杭州的杭州鸭,而采集到的7株N9亚型NA(即H7N9病毒)则来源于韩国禽类。
该团队认同中外学术界对HA来源的结论,但对NA来源则有异议。为此,研究人员分析了全球共享的流感数据库。其中长度大于1000核苷酸的N9基因序列共321个NA序列,并由此推导出相应的蛋白质氨基酸序列,最终证实,H7N9禽流感病毒的最重要蛋白HA(N9基因)来源于中国江苏洪泽湖花脸鸭。
研究人员认为“最重要的依据”是,从基因的核苷酸和蛋白质氨基酸序列相似性搜索结果来看,H7N9病毒的最重要蛋白NA与H11N9病毒在核苷酸和氨基酸层次上序列的相似性分别是96.2%和96.8%;而7株韩国株NA亚型株相似性分别为93.3%至95.5%和87.9%至96.4%。前者远高于后者。
研究人员还认为,杭州是H7N3病毒的分离地,也是本次流感流行的主要疫区之一,洪泽湖区也是H11N9病毒的分离地。也就是说,从本次流感最初发生地、H7亚型HA贡献株分离地以及H11N9病毒分离地点来看,均位于中国的华东地区,从地理位置上来看,病毒株发生重组的可能性也远高于韩国株。(来源:中国科学报 孙国根 黄辛)