近日,记者从中国农业科学院北京畜牧兽医研究所获悉,该所畜禽资源收集、保护与创新利用团队利用马高密度基因芯片对德保矮马矮小特性进行研究,发现了影响德保矮马矮小特性相关关键基因TBX3,首次从全基因组水平上揭示德保矮马矮小特性存在不同于国外矮马的独立矮化机制。该成果已在线发表于国际学术期刊《基因组生物学和进化(Genome biology and evolution )》。
体尺大小是进化过程中物种间及物种内差异较大的数量性状。了解体尺大小相关的遗传基础对研究人类疾病相关的遗传机制以及家养动物人工选择和提高生产性能的重大课题之一。
该团队长期致力于动物遗传资源评价和特色基因资源挖掘研究,并探索遗传资源的保护和可持续利用。此次通过利用马高密度基因芯片(GeneSeek Equine SNP 65K)对中国体高差异较大的三个品种(德保矮马、蒙古马、伊犁马)和国外32个马匹品种构建了系统进化树并检测选择信号。国内外马品种构建的系统进化树显示,德保矮马可能存在与国外矮马不同的独立驯化历史事件。选择信号及全基因组关联分析发现,在德保矮马基因组上检测到了523个显著选择信号位点。包含TBX3基因的基因组区域的三个SNP位点与德保矮马体高相关性最高。结果表明,TBX3 基因是在决定德保矮马体尺差异中发挥了重要作用的关键基因。
该研究为德保矮马起源及矮小特性的遗传基础提供了分子理论依据,同时也为标记辅助选择在德保矮马育种中的应用奠定了基础。
该研究由中国农业科学院科技创新工程和家养动物种质资源共享平台资助。(来源:中国科学报 邬震坤 李晨)