来源:BMC Biology 发布时间:2018/12/25 11:14:10
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与秀丽隐杆线虫分享科研的乐趣 | BMC Biology十五周年作者专访

 

论文标题:On microbes, aging and the worm: an interview with David Weinkove

期刊:BMC Biology

作者:David Weinkove

发表时间:2018/11/01

数字识别码:10.1186/s12915-018-0600-x

原文链接:https://bmcbiol.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12915-018-0600-x?utm_source=other&utm_medium=other&utm_content=null&utm_

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微信链接:https://mp.weixin.qq.com/s/cybNvdI1_sIPDS9Jzm5GkQ

David Weinkove是英国杜伦大学的副教授,他主要利用模式生物线虫(Caenorhabditis elegans)来研究宿主-微生物之间的相互作用。David一直在关注微生物影响宿主生理(包括衰老)的方式。此次采访中,David向我们介绍了他所研究的主要问题以及这些年的研究进展,还有他管理实验室的一些指导原则。

为了庆祝BMC Biology建刊十五周年,我们与BMC Biology的作者和评论家进行了访谈,分享了他们对研究中遇到的成就与挑战的见解,以及对出版创新和同行评议的思考。

以下是与作者David Weinkove的采访内容分享。

David Weinkove

您所研究的主要问题是什么?

我们目前研究的一个关键问题是细菌如何影响动物生理学,特别是衰老。由于动物起源于微生物世界,因此微生物肯定在塑造动物的进化方面起到一定的作用。动物们既有抵抗微生物的机制,也能受益于微生物,例如他们依赖于微生物来合成关键的维生素。因此,我们利用线虫Caenorhabditis elegans和大肠杆菌这一简化的系统来试着揭示这些关系,以及它们对衰老的影响。

最近,我对这两个相关的问题产生了兴趣:1)能否将衰老解释和理解为是生命系统运作的突现特征?2)我们能否通过自动化操作改进对秀丽隐杆线虫衰老的测量方式,以便获得更深入的理解?

由于秀丽隐杆线虫极易生长并且也很容易对它进行遗传修饰,因此我常常在想,我们能否使用秀丽隐杆线虫来获得有用的产物呢?我们正在尝试使用秀丽隐杆线虫来生产出一种可能成为自身免疫性疾病治疗药物的蛋白质,该蛋白质目前只能从寄生虫中分离出来。

您已经在BMC Biology上发表了好几篇论文。其中,第一篇是您在博士后研究期间发表的,最近一篇今年刚发表。在这段时间内您的科研兴趣是怎样发展的呢?

我的第一篇BMC Biology文章研究了秀丽隐杆线虫AGE-1酶的工作机制。它可以通过遗传学、生物化学和显微观察相结合的技术得到很好的解答,但首先,我们要了解这个基因/酶是如何起作用的。我现在的科学问题通常都是从一个更为“生物学的问题”开始,比如细菌如何影响衰老。话虽如此,但我的另外两篇BMC Biology文章来自于偶然的发现:大肠杆菌的自发突变体延长了秀丽隐杆线虫的寿命,以及叶酸需要通过细菌来补给到蠕虫。

回顾过去,有没有哪个研究课题特别具有启发性,特别艰难,或是让您特别难忘?

追踪研究能显著延长秀丽隐杆线虫寿命的大肠杆菌菌株是一段特别棒的经历,这让我意识到寿命的增加与这个菌株所含的RNA干扰质粒无关,而是由大肠杆菌染色体的自发突变引起的。我通过互补筛选鉴定确认了这个突变,发现它是通过阻止细菌的叶酸合成来提升蠕虫寿命的。我们现在进行的大部分工作是在延续这一发现。

有没有一篇文章或者一位同行给您的研究带来灵感或启发?

建立自己的实验室之前,我曾在十个不同的实验室工作过,所有的PI以及所有共事过的同事都让我收获颇丰。

您有没有管理实验室的一套方法?能不能和我们的读者分享一下?

我认为让实验室成员尽可能多地拥有自主权很重要,但这并不是说不管他们。支持和自主缺一不可。短期内它可能没有详细指导那么有效,但从长期来看,自主权能提升他们在项目中的主人翁感,让他们更有动力,并且成为更优秀、更独立的科学家。

如果能穿越时空,您对过去的自己有哪些忠告?

“写出来”。这也是对以后的我的忠告!我发现在写作时,很难不去考虑读者的感受,这使得我后面需要解释每个陈述背后的层层意义。

同时,不管是过去还是将来,都要“享受科学”,因为科学的乐趣是无穷的。

对于出版方面的创新举措,您有何期待?

期刊应该给予审稿人一定的报酬。负责的同行评审过程既困难又耗时,审稿人应该得到奖励。另外,如果能获得报酬的话,他们应该就不会那么不爽了吧!

摘要:

David Weinkove is an associate professor at Durham University, UK, studying host–microbe interactions in the model organism Caenorhabditis elegans. David has been focusing on the way microbes affect the physiology of their hosts, including the process of aging. In this interview, he discusses the questions shaping his research, how they evolved over the years, and his guiding principles for leading a lab.

阅读论文全文请访问:

https://bmcbiol.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12915-018-0600-x?utm_source=other&utm_medium=other&utm_content=null&utm_

campaign=BSCN_1_DD_BMCBIo_15anniv_Weinkove_Sciencenet

期刊介绍:

BMC Biology(https://bmcbiol.biomedcentral.com/, 5.770 - 2-year Impact Factor, 7.556 - 5-year Impact Factor) is an open access journal publishing outstanding research in all areas of biology, with a publication policy that combines selection for broad interest and importance with a commitment to serving authors well.

来源:科学网

 
 
 
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