为完成南海北部开放航次预期的任务和目标，中科院南海海洋所“实验3”号科学考察船于2009年8月31日离开广州新洲码头，赴南海北部海区执行海上科学调查和研究任务。
本开放航次由中科院南海海洋研究所副所长王东晓研究员担任首席科学家，参加该航次的有来自中国科学院南海海洋所、中国科学院海洋研究所、中国科学院广州能源研究所、中国科学院遥感应用研究所、中国科学院水生生物研究所、国家海洋局第二海洋研究所、厦门大学、上海同济大学、山东大学威海分校、中国地震局地震预测研究所、上海市地震局、中国水产科学研究院、中石化勘探开发研究院13个科研教学单位的57名科研人员。考察内容包括海洋水文观测、海流及气象观测、上层海洋光学参数测量、海洋生物与生态化学参数观测、气溶胶测量、海洋沉积物取样等。调查区域位于北纬18度以北的南海北部海区，共设站位87个，其中CTD大面站87个、海流观测潜标系统4套。本次海上调查约22天，总航程2400海里，计划于9月下旬结束。
2009年开放航次是开放航次序列的第六个航次。开放共享航次作为一个强有力的海上共享观测平台，充分体现发挥多方科研力量的综合优势、加强海洋现场数据的长期积累、推动长期观测研究及重大成果产出、促进海洋科学研究的多学科交叉与整合以及所内外科学家的交流与合作的宗旨，必将为推动我国海洋观测平台的共享做出更大的贡献。
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